Các đại biểu cho rằng 5 đối tượng trong dự thảo là chưa đầy đủ. Ngoài 5 đối tượng này, gồm xăng dầu, than, dung dịch HCFC, túi nhựa xốp và thuốc bảo vệ thực vật, Quốc hội muốn có thêm những sản phẩm khác trong danh sách này, trong đó có thuốc lá.
Các đại biểu cũng đề nghị luật phải lý giải đầy đủ về căn cứ quy định đối tượng chịu thuế, đối tượng gây ô nhiễm môi trường mà chưa được quy định chịu thuế.
Dự thảo còn được coi là chưa ấn định tiêu chí đánh thuế phù hợp, và cần tánh tình trạng thuế chồng chất lên nhau.