在陳水扁總統企圖以闖關方式前往印尼訪問失敗後，印尼外交部長公開表示印尼永遠不歡迎陳水扁到訪，這番言論今天引起台灣當局反感，宣布停止對印尼的援助，並且檢討對印尼投資政策以及考慮禁止印尼勞工到台灣工作。
經濟部長林義夫表示，陳水扁出訪事件，將使台灣調整目前鼓勵台商前往東南亞投資的南向政策，特別是對印尼部份將有影響。林義夫說：南向政策並沒有任何改變，我們還是繼續推動，但是我們南向政策的對象有十個國家之多，我們當然有一些優先的順序，那些國家對我們友善的話，我們當然列在優先的順序。
雖然林義夫並無明確說明印尼是屬於不友善之列，但是外交部長簡又新就直接點名印尼的做法並不友善。簡又新說：不去是一回事，但是用這種非常不友善的方式來講話，那當然是另外一回事。在印尼，在耶加達正式向印尼提年非常嚴正的抗議與不滿，目前還沒有回應，因此我們還在觀察。
簡又新表示，未來如何再進一步對印尼採取行動，仍要觀察印尼當局對台灣抗議的反應再來決定。
不過，副總統呂秀蓮就認為，這次並非外交上的失敗，因為借由今次事件，印尼人民已經知道北京在外交上打壓台灣的事實。呂秀蓮說：天下之大，何必一定要到印尼呢？我們印尼之行，雖然總統沒有去，但是"不戰已屈人之兵』，在印尼，台灣問題會變成一個熱門的問題，所以我覺得，真正外交的成敗不是看短線。我覺得，現在應該會引起印尼的民間、中央、地方之間一個全新的思考。"呂秀蓮認為，借由這次事件，印尼人民會思考出在外交問題上不受北京威嚇的道理。