針對曾蔭權當選香港特首，台灣大陸委員會發表示聲明祝賀。陸委會在聲明中期望，曾蔭權能夠秉持“締造和諧、福為民開”的參選理念，突破舊有框架，以新思維推動台港關係。
陸委會副主委游盈隆表示，香港在兩岸間扮演重要的中介地位，歡迎港府來台設立辦事機構，也期望在既有的聯繫協調機制上，港府能發揮更積極正面的功能，加強政府間的溝通與合作，共同提升台港關係，並且對兩岸的和平與穩定作出貢獻。
游盈隆說：我們當然期盼台港關係能夠提升，但是就過去若干的事項看起來，似乎港府在處理台港關係的事務上，本身似乎並不具有充份的自主性。游盈隆表示，曾蔭權上任之後，在台港關係上面的自主性能否提升，並且進一步在台港關係上有更大的進展和更多的突破，陸委會將持續觀察。
陸委會官員指，目前台港之間的聯繫，主要是靠台港駐香港辦事處，也就是俗稱的中華旅行社來推動。但是由於董建華擔任特首時，凡事都怕北京不高興，所以對中華旅行社有很多限制，而且對台政策比北京還要保守許多，甚至連中華旅行社官員，都很難直接和港府官員接觸。陸委會希望，新特首能積極改善台港關係，增加各方面的交流，以及提升中華旅行社與港府的接觸層面。