美國國務院指陳水扁推動入聯公投﹐違反對美國的“四不一沒有”的承諾﹐陳水扁回應說絕對不會撤回公投﹐而馬英九認為陳水扁違反四不中的兩不。
美國主管兩岸事務的副助理國務卿柯慶生，邀約台灣傳媒做背景說明時指出，總統陳水扁推動入聯公投，違反他向美國保証，任內不舉行統獨公投的承諾。柯慶生說，美國反對入聯公投，並認為不但不明智，而且具有挑釁性和危險。
總統陳水扁週五回應說，絕對不會撤回入聯公投。陳水扁說：我相信國際社會也慢慢的了解到，這是台灣的民意，是由下而上，由外而內，作為總統的也不能抗拒，作為總統的也不能將他否定跟推翻，所以入聯公投絕對不可能撤銷，也不可能改變。縱使中國國民黨想用返聯公投來杯葛，也是徒勞無功。
國民黨總統候選人馬英九說，美國國務院的副國務卿就提過，入聯公投是邁向法理台獨的第一步，而台獨是陳水扁“四不一沒有”保証的第一不。馬英九指，這次美國更將入聯公投認定為統獨公投，也就是第四不。馬英九表示，由這些言論，美國認為陳水扁已經違反了四不承諾裡面的兩不。
行政院發言人謝志偉表示，台灣入聯公投由人民決定，不是總統說要就要，也不是中國國民黨或中國共產黨說不要就不要，公投是民主人權的極致，沒有人可以對台灣說三道四。(自由亞洲電台鍾廣政 台北報導)