方勵之逝世的消息傳出後，中國新浪、騰訊、搜狐等微博立刻有人刊發，但隨即遭到刪除。杭州網絡維權人士昝愛宗，周一接受記者訪問時指，他將方勵之去世的消息轉到新浪微博，不到兩分鐘，即被刪除，並留下 “抱歉，此微博不適宜對外公開，如需幫助，請聯繫客戶服務” 等字句，他指，從周日開始，已有不少大陸網民在微博上刊發方勵之的死訊或紀念感言，但隨即遭到當局刪除，昝愛宗批評當局做法不明智。
他說： “方勵之先生是一個已流亡美國的一個著名學者，他在八十年代一黨專政下推動中國民主，被開除黨之後更積極，他促進了學潮，當局對他的逝世的消息及任何留言封殺，這是很不明智的做法。”
記者在中國搜索引擎百度打 “方勵之”，結果打出 “根據相關法律法規和政策，部分搜索結果未予顯示” 的字樣，也沒有方勵之去世的任何消息出現。
昝愛宗與大陸多名民運人士，周日均透過海外維權網站發文悼念方勵之，其中天安門母親發言人丁子霖在悼詞中指，對方勵之不幸離世表示萬分悲痛，並致以深切悼念，祈求家屬節哀保重。天安門母親另一成員張先玲向記者指，在中國極權制度下，方勵之敢於發言推動中國民主運動進程，是一個舉足輕重的代表人物。
她說： “他八十年代在中國的高校任教，是一位傑出的民主運動啟蒙者，先生的言論和主張在知識界相傳甚廣，啟示了中國老、中、青三代人，他其後被迫流亡往美國後，亦經常發表文章，參予營救活動，亦有為我們發聲。”
於99年被以“顛覆國家政權罪”判監9年的中國民主黨成員查建國，對方勵之的逝世感到震驚及十分悲痛，他指，89年方勵之率先給鄧小平公開信要求推動民主化同釋放魏京生，間接促進了學潮，他認為方勵之是真正的學運精神領袖。
他說： “方勵之先生是著名的科學家，亦是80年代中國大陸最有影響的知識份子，即使他其後流亡美國後，他亦不斷發聲推動中國的民主進程，他是一個真真正正的民主人士，他對我有很大的鼓勵作用，他的離世，我感到很悲痛。
八九民主運動時，祇是一名中學生的中國民主黨杭州成員鄒巍向記者指，杭州民主黨創黨成員王有才，是方勵之的學生，鄒巍指從王有才處獲悉很多有關方勵之的學說，被他啟發甚深，方勵之可算是學生民主思想的重要指導者。
他說： “方勵之先生是杭州人，當年我們的創黨成員王有才亦跟他念物理的，王有才其後在杭州創立民主黨部，很多民主理論及學說都是來自方勵之，是一脈相承，我們這一代亦深受他的影響，方先生給了我們很多經驗及前曕性的探討。”
鄒巍指，他準備與數名當地維權人士為方勵之舉行小型追悼會，但具體詳情暫不便透露，以免暴光後遭當局打壓，鄒巍指，方勵之作為上世紀八十年代中國民主自由領軍人物，他與作家王若望、記者劉賓雁三人，在1987年被合稱 “資產階級自由化三代表”，由鄧小平點名開除中共黨籍，後來三人分別流亡美國，並先後客死異鄉，鄒巍呼籲北京盡快讓流亡者回國，應順應潮流，勿再剝奪因政治異議而流亡者回國的權利。
因八九學運流亡美國的方勵之，在當地時間周五於阿利桑拿州圖森市家中離世，終年76歲。