監察院完成319槍擊案調查報告，指陳水扁執政時，台南地檢署和警方的調查有四個疑點，準備糾正台南地檢署。
負責本案的監察委員吳豐山，已經將報告送交特別偵查組，要求就疑點重新調查。吳豐山說，警方和台南地檢署的調查報告，認定唯一的凶手林義雄畏罪自殺，他指，從陳義雄的屍斑與死亡時間不符，到台南地檢署無解剖死者，就認定係自殺等不合理過程，高檢署都應該重新調查。
吳豐山說，監察院亦推翻之前係林義雄不滿陳水扁，因而對陳水扁開槍的講法，監察院認為，第一槍係射向前副總統呂秀蓮，第二槍射陳水扁乘坐的吉普車。
警方之前的報告認為，凶手用一把槍，短時間內連射兩發子彈，所以認定兇手祗有一個人。監察院推翻這個結論，認為無證據支持警方的講法。
吳豐山說：包括陳再福，陳再福就是陳水扁的待衛長作證都講，陳水扁平常褲子穿在肚臍這個地方，傷口在（肚臍）下五六公分的地方，為什麼沒有血蹟沒有彈孔，這一部份各方面都有不同的說詞，也應該再加以調查。
前副總統呂秀蓮說，監察院的報告，和她的看法幾乎一樣。她一直不相信祗有一個兇手，更唔信警方說祗有一把槍。呂秀蓮說：我的立場一直都一樣，陳義雄不是唯一的真兇，但是不是知情或者參與，就要進一步去查，不是他這樣就完全沒事。不然平白為什麼人家會殺他，所以還是有一些疑點。
呂秀蓮亦強調，她不相信319槍擊案，係陳水扁自導自演。呂秀蓮說：老實說，陳總統是自導自演我也不相信，因為那天從到到尾我跟他在一起。我們本來有說有笑的，後來一槍打下去痛到不得了，他臉上開始發黑，這不能作假的啦。
民進黨立法院黨團發言人葉宜津認為，監察院的報告，根本無拿出證據證明自己的講法。葉宜津說：319的調查報告，不知道已經出爐幾份了，我們現在祗希望這個事情，因為我們沒有調查權，所以無論是什麼真相，祗要拿出證據來告訴我們就夠了，不要一天到晚放話。