陳水扁執政四年來，先後遇上亞洲金融危機及SARS疫情，經濟大受打擊，在今次總統選舉中，台灣經濟問題，成為國民黨陣營攻擊的目標。陳水扁上台後， 台灣股價加權指數從他就職時的10186點，幾個月內下跌到四千多點。直到近期，加權指數在6700點水平上落，指數仍然較他上台之前低三成幾。
國民黨認為，過往四年台灣失業率，由國民黨交出政權時的不到百分之三，一年內上升到百分之五點三，之後就一直維持在百分之五以上。而經濟增長率，由國民黨時的平均超過百分之五，一舉暴跌到負百分之一點八。
民進黨籍的行政院長游錫坤對於國民黨的抨擊回應說，當香港近期的失業率高居百分之七時，台灣失業率祗有百分之五。如果以經濟增長率來算，台灣去年的增長率接近百分之三點二，是亞洲四小龍之冠。
游錫坤表示，如果說他們在經濟上做得不好，祗能說是台灣換了政府後，換唔走國民黨執政時，留下複雜的經濟問題，例如：二萬四千億新台幣的債務，九二一地震後的殘局，以及世界經濟不景氣。
曾經在上次總統選舉中，替陳水扁製訂競選策略的政治評論員胡忠信表示，執政者說自己做過什麼是沒用的，最重要是民眾有無感受到。
胡忠信認為，民進黨的經濟政策失敗，原因是他們定出決策時，都祗為佔台灣人口三分之一的支持者著想。民進黨執政前，堅決要停建核四，但是在執政後，並沒有措施穩定台灣經濟。核四宣布停建後，部份外商對台灣失去信心而離開，造成經濟蕭條，使陳水扁無力挽救。胡忠信認為，陳水扁眼看經濟殘局無法收拾，一般民眾（因此）開始不信任民進黨，為了脫離困境，陳水扁祗好使出轉移目標的手法，叫出各種迎合他最忠實支持者，也就是台獨派的政治口號。
胡忠信認為，陳水扁提出一邊一國，制訂新憲法，到最近推動公民投票，都是阿扁政府無力處理經濟難題後，企圖在選舉中，分散民眾焦點和以凝聚本土勢力， 以及台獨支持者選票的手段。
兩岸政策，是這次總統選舉的重點之一。陳水扁就一直強調，四年前提出不宣布台獨，不將兩國論加入憲法等承諾後，平均每個月都會釋放善意。如果連任，更會尋求設立兩岸和平互動架構，以及推動直航。但北京就指他推行漸進台獨政策，公投更將破壞兩岸和平穩定。
究竟陳水扁執政以來，兩岸關係有無改善呢?
民進黨政府強調，是大陸以"一個中國"來阻擋兩岸恢復接觸。而北京對陳水扁的評語，從剛上任時的"聽其言，觀其行"，到後期直指他是搞台獨分裂，可以看出其實毫無進展。
大陸委員會副主委陳明通表示，民進黨執政以來，不斷推出改善兩岸關係的政策，是北京不願意做出對等的善意回應。
不過，國民黨執政時的大陸委員會副主委鄭安國就表示，民進黨在兩岸問題的政績跟不上兩岸交流的速度。而且更將他以前推行的許多政策，列入民進黨政府的政績或是乾脆灌水。
台灣大學政治系教授明居正表示，民進黨支持者大部份對大陸有敵意，所以難以推動兩岸政策。民進黨又擔心，兩岸關係發展得好，台灣就要完全依賴大陸。即使不得不依賴大陸，都要想辦法抵抗。
明居正說，由於北京對陳水扁不信任，沒有回應陳水扁的所謂善意。陳水扁祗好退縮尋求台獨支持，所以政策反反覆覆。例如：在他四年任期內，曾經提過十次一中問題，但是七次贊成一中，三次提出一邊一國。在三通上，陳水扁也發言過十三次，但其中有十次是贊成，三次反對。
前陸委會副主委鄭安國認為，就算陳水扁連任，大陸也不會回應陳水扁的善意，民進黨仍然會不斷反反覆覆。鄭安國說，在選情不樂觀底下，陳水扁宣布大陸各地對台部署飛彈的數目，希望凝聚本土意識的選票，但是就導致北京破獲三個大型台灣間碟網，兩岸之間的信任危機加深，未來唔理邊個當選，都需要時間來修復雙方的信任。
前民進黨主席許信良接受我們訪問時說，陳水扁執政四年來，經濟增長率跌到五十年來最低，民眾都可以感受到房地產、股市暴跌和失業等困擾，政府更創下十萬億新台幣的債務。
許信良說，兩岸關係變壞了。而對外關係，因為公投導致多個大國的反對，在國際上更孤立。
許信良指出，民進黨一年前就開始總統競選活動。由於無法用政績爭取選票，只好採用轉移焦點策略。他分析陳水扁的競選策略有三個。第一是：民調陸續發現，很多民進黨支持者，也對陳水扁感到失望，傾向不投票給任何一方。陳水扁喊出公民投票，就是希望鼓舞基本支持者的鄉土熱情。
許信良認為，阿扁的第二個策略，是用政府資源賄選。他舉例說，去年有SARS疫情時，政府爭取五百億預算，其中不少是用來買票，就連的士司機，也可以每人分到三千元新台幣。
買票的最明顯的對象，莫過於過往最支持國民黨的客家人。民進黨在選前，補助六億新台幣給客家社團，使民進黨在客家地區的支持率明顯上升。
許信良說，陳水扁的第三招，是針對佔選民一成半，有自主判斷力的中間選民。他指出，多個調查顯示，中間選民因為不滿陳水扁施政，傾向投票給國民黨候選人連戰，所以陳水扁用抹黑的方式，來使人覺得，國民黨和民進黨都一樣差。
許信良說，這個抹黑工程非常龐大，包括指控連戰漏稅、貪污、打老婆，並揭發支持國民黨的政治評論員和學者專家隱私，來叫他們收聲。由於動用政府資源來進行，細微到連戰的大女連慧心謮小學時某年某月某日請假，或者邊日上堂唔專心被先生鬧，都查得出來。(鍾廣政)