中國衛生部副部長王隴德，在菲律賓首都馬尼拉出席世界衛生組織會議時向記者表示，中國衛生部嚴格規定，研究員祇能在四個定點實驗室研究非典型肺炎冠狀病毒。他說：到所有發生過非典型肺炎、有標本的省市的醫院，把病毒樣本全部收集起來。使用這些標本，必須獲衛生部批准。
另一名衛生部副部長黃潔夫則說，醫學界目前對非典型肺炎冠狀病毒的認識尚淺，難以完全防止非典型肺炎疫症再度爆發。他說：肯定這次比上次好多了，最少不會出現好像今年上半年的情況。但預防措施是否足夠，我想不會足夠。因為我們現在對非典型肺炎的瞭解不多。冠狀病毒的特點、傳播渠道等還不知道。到現在我們還未知道病毒如何從動物傳播給人類。
據香港《文匯報》報道，中國政府正籌備重組全國防治非典型肺炎指揮部，由國務院副總理兼衛生部長吳儀負責，協調十多個中央部委，以及中共中央、國務院、軍隊系統、北京地區等數十個部門和單位的人員，在原有機制框架上，重新啟動防治非典指揮部。
目前，各省市政府正根據衛生部制訂的預案，舉行預防非典模擬演習。
廣東省衛生廳已準備在本月下旬舉行防治非典演習。廣東省現有一百五十八家定點醫院，專門接收非典型肺炎病人。