台灣經建會主委陳博志在二十二日表示﹐小三通的目的是促進離島發展﹐所以必須有合理規範﹐不能沒有條件限制﹐以免妨礙台灣經濟發展及國家安全。陳博志說，小三通是未來大三通的試驗，要考慮到各方面的限制﹐比如中國產品進口到金門﹐再進入台灣本島﹐就有可能會妨礙台灣經濟發展。小三通必須避免影響台灣經濟與國家安全。而台灣新任總統陳水扁在就任第二天﹐即飛抵金門前線視察﹐強調國家安全是全民共同的關心的話題。新政府將在國家安全前提下檢討現行僵化的三通政策。針對有人批評他在就職演說中未提到三通或小三通﹐陳水扁解釋說，這是他的總統就職演說﹐而不是行政院長的施政報告﹐更何況如果兩岸關係沒有改善﹐未能重啟"辜汪會談"的協商大門﹐要三通又談何容易。陳水扁表示，行政院相關部會同海基會共同推動三通和小三通的議題。此外，中華航空公司總裁接受路透社訪問時表示﹐華航計划兩岸實現通航後，進軍大陸市場，初步會同大陸的同業合組聯營公司發展貨運業務﹐華航正考慮与中國航空公司或東方航空公司合作。華航表示，計劃仍在初步階段﹐不過在台灣當局解除禁制前，不會貿然開展計劃﹐但他強調大陸的客運和貨運潛在市場龐大﹐不容忽視。
