大赦國際星期四發表聲明,表示擔心中國政府會利用911事件來為他們在新疆地區鎮壓穆斯林的籍口。大赦國際在聲明中指出,雖然中國政府需要确保當地居民的安全,但是北京混淆分离主義與恐怖主義的區別,會導致許多民眾成為政府違反人權的犧牲品。中國政府最近在新疆地區發起反恐怖主義和反分裂運動,主要目的是清除該地區的民族分裂勢力。外交部發言人孫玉璽,在星期四的記者會上表示,當局有証据顯示東突分子,亦就是新疆獨立活動人士從事恐怖活動。他呼吁國際合力打擊。另外,大赦國際還擔心中國政府打擊新疆獨立運動的做法,會引發對西藏分离運動的新一輪鎮壓。