陳水扁總統原本計劃在這個星期一，以私人渡假方式前往印尼日惹訪問，再以在印尼首都轉機方式，達到進入雅加達訪問的目的，不過，印尼傳媒提早報導這個消息，在北京強大壓力下，印尼不同意陳水扁前往訪問。
印尼外交部長維拉尤達向當地傳媒表示，如果陳水扁執意要訪問印尼，雅加達將拒絕讓他入境；印尼外交部發言人馬諦甚至表示，陳水扁在印尼不受歡迎，印尼將永遠不會歡迎台灣的總統到訪。印尼政府不祗表明不歡迎陳水扁到訪，甚至從以前的中華民國改為以"中華台北"來稱呼，明顯要貶低台灣的地位。
台灣的外交部長簡又新表示，陳水扁印尼的預訂行程，是希望藉這個機會提昇雙方的關係，使兩邊達到更進一步互利的關係，但是這個行程由印尼外長對外否認，不但沒有達到效果，反而產生反效果，外交部感到非常遺憾。簡又新說：由這次預定出訪的工作我們也了解到，我們的外交工作，無時無刻都在中共的打壓之下在進行，但是我們的工作同仁以及本部，絕對不會因為中共的打壓而有任何退縮和畏卻，相反的，在這次之後，外交部秉持的是我們中華民國要站起來，要積極的走出去。
對於印尼外交部的言論，簡又新就下令外交部召見印尼駐台灣代表，表達強烈抗議，並要求代表處向印尼政府完整表達這份抗議。
中國同印尼兩國官方代表，星期二在雅加達簽署協議，中方同意向印尼提供四億美元的優惠信貸，用於進口中國的成套設備以及進行電力、鐵路運輸等基礎設施方面的建設。