香港行政長官董建華周三宣布，成立一個獨立調查委員會，檢討今年九月立法會選舉的安排，同時公布選管會提交的中期調查報告。
董建華在聲明中指出，由於選管會提出的中期報告，顯示選舉的策劃和執行工作有需要改善，因此將會委任具備法律、資訊科技和物流知識的專業人士，在三個月內作出調查，並向行政長官提交報告。選管會歡迎行政長官的決定。
根據選管會向行政長官提交的中期報告，選管會承認由於在票箱測試時，並沒有使用印製選票的厚紙作測試，導致嚴重低估票箱實際容量。而中央統籌中心又沒有特別應變計劃應付票箱不足等情況，致令多個票站出現混亂。
報告承認，有兩個新界東選區的票站使用紙箱作臨時投票箱，港島區上環票站暫停運作，更有五十六個票站在投票期間打開票箱，但選管會堅持有關措施並沒有影響投票的公正性，亦不違反香港選舉法例。
有四個票站的主任拒絕某些候選人代表進入監察票站關閉，選管會解釋這是由於票站主任對票站工作手冊誤會所致。對此，選管會己打算修改工作手冊，並對四個票站的票站主任發出警告信，有可能交由公務員事務局作出懲處。但選管會堅持選舉公正性不受影響。
選管會主席胡國興大法官表示他的報告雖然認為選舉是在公平、公正和誠實情況下進行，但他無意掩飾選管會以及選舉事務處所犯的錯誤。他認為這些錯誤是無可掩飾的。他表示選管會會承擔本次選舉中失誤的最終責任，但他堅持要在完成檢討後，才會提出呈辭。我們負責監督選舉，以及一切安排，最終責任在我們選管會身上。他說﹕退休談何容易，若我們臨陣退縮，這是我們不負責任，我們有責任搞好選舉。
選舉管理委員會是由行政長官委任的委員會，並不從屬於任何政府部門，主要負責監督和安排選舉事務處舉辦選舉。