台灣的總統陳水扁總統表示，他們充分認知到，北京當局堅持“一個中國”原則的立場，但是同時也要呼籲對岸正視中華民國存在的事實，以及二千三百萬台灣人民追求民主的信念。
陳水扁表示﹕如果兩岸都能彼此諒解、相互包容，就能透過和平對話、理性協商來解決歧見、消除對立。“九二香港會談”就是表現了這樣的精神。
陳水扁認為，未來的兩年是海峽兩岸重啟對話、共同謀求長期穩定與和平發展的“關鍵機遇期”。陳水扁說：雙方的政府及領導人，都應該掌握時機、運用智慧，為長遠的發展打開良性的“機會之窗”，為人民的生活謀求平安幸福的基礎。儘管對岸由於諸多因素無法立即回應我方的善意和誠意，但是我們的決心和耐心不會因此而改變。我們也要再次重申，總統520就職演說及今年國慶談話所揭示的兩岸政策發展方向，在任期之內不會有任何的改變。在此“兩個不變”的基礎之上，政府各部門應該積極研議重啟對話、降低緊張、合作發展的兩岸“陽光政策”。
陳水扁並且提出，核子武器、生物武器、化學武器等大規模殺傷性武器都應禁止在台海使用。他說，他願意公開承諾，絕不發展此類大規模毀滅性武器，也要鄭重呼籲中國公開宣布，放棄發展及使用大規模毀滅性武器。
陳水扁最後表示，為避免誤判或擦槍走火，台灣建議兩岸應共同商討劃定軍事緩衝區。雙方戰機、軍艦非必要不得進入該區域，如果必須進入就應該事先知會。