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多間台灣傳媒報導指，民進黨政府是以由第三國進或者由第三國出，作為談判底線，同意中華奧會和北京奧會協商聖火來台路線。報導指，當雙方達成共識後，台灣卻在大陸宣布前更改政策，拒絕聖火來台。
總統陳水扁下晝被傳媒詢問為什麼推翻和北京協商的承諾時說，他也是看電視才知道聖火路線。陳水扁說：我們是聽到他們做這個宣布之後，相關部門才做反應，之前大家的共識就是不能夠矮化台灣作為一個主權國家。
大陸委員會主委陳明通，並沒有否認兩岸是以第三國進入台灣，或者第三國出來做協商。陳明通指，之所以推翻協議，是因為北京矮化台灣，例如：將台灣稱為中國台北，以及將聖火路線稱作國內路線。
不過，陳明通所指的矮化，大部份都是台灣拒絕聖火入境後，大陸傳媒星期五的用語。前國民黨主席馬英九指，這明顯是政治干預體育的事件。馬英九說：正因為民進黨在辦總統大選黨內初選，正因為這種情況，出現了一個跟國際主流意見相反的決定，這是一種沒有自信的表示。我們中華民國是一個主權獨立的國家，不要怕別人矮化。
曾經奪得奧運跆拳道銀牌的立委黃志雄說，大陸依照台灣提出的條件定出聖火路線，但是台灣最後臨時反悔，要求進出都經第三國。黃志雄指出，政府不應該出爾反爾，破壞體育精神﹐也傷害台灣的國際誠信。(自由亞洲電台鍾廣政 台北報導)