在上星期六縣市長選舉行，總統陳水扁和行政院長謝長廷一直沒有公開露面過。雖然陳水扁目是仍然行蹤成迷，但是行政院長謝長廷就開始恢復上班，並且表示，陳水扁同意他暫時留任行政院長。
謝長廷說：“現在也有人說‘三合一’（縣市長選舉再結合鄉鎮議員和鄉鎮長一起舉辦的選舉）是敗選的關鍵，‘三合一’是行政院推動的，我也願意承擔責任。但是我口頭請辭的時候，總統他說以安定為優先，聽取各方面的意見，我就是在做。我們民進黨其實就算選贏也是要進行內閣改組，祗是幅度大小而已，至於時間和幅度，就由總統去決定。”
對於傳媒追問，外界風評較差的官員，例如：新聞局長、教育部長和交通部長，會不會在這次一起下台？謝長廷就拒絕回答。
在縣市長選舉前就一直提出，由國會多數黨組閣的國民黨主席馬英九表示，目前國民黨並未掌握國會穩定的絕對多數，須由國親聯盟甚至加上無黨聯盟立委，才有比較安定的多數來組閣。
馬英九說：“所謂多數組閣的意思，是釋出組閣權，讓國會的多數黨，或者多數的聯盟來組閣。這個時候總統扮演的角色，是接受這個人選，而不是由他來指定。”
馬英九表示，民進黨過去一直不能接受這種方式，始終沒有落實雙首長制特色，當總統所屬政黨在國會不是多數時，制度自然換軌成內閣制，總統所屬政黨在國會成為多數時，自然換軌成為總統制，因此，雙首長制的憲政精神到現今都未貫徹。