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雖然在選舉前以國民黨為首的泛藍陣營被輿論認為會大敗，但是泛藍陣營最後仍然險勝對手，在立法院保持住過半數的席位。學者認為，這個結果有助於穩定兩岸關係，但不要期望兩岸會有突破性的進展。
台灣大學政治系教授張麟徵表示，泛藍陣營一向在兩岸關係上扮演煞片的角色。最近陳水扁政府提出一連串挑釁兩岸關係的政策，使到民眾擔心兩岸發生衝突，因此在最後關頭，選擇泛藍的候選人，希望能夠維持台灣的安定。
張麟徵認為，陳水扁在選舉前提出的以公民投票方式來制訂新憲法，以及正名運動，將會持續推行，未來兩岸關係將會更緊張。
張麟徵表示，其實國民黨在此次選舉能否保持過半數優勢，對兩岸關係影響不會太大。她指出，北京已經看清楚，國民黨無法在兩岸問題上制衡民進黨，所以早就要求美國出面看管陳水扁這個麻煩制造者，不無美國無法控制，大陸就不排除採取激烈手段。
張麟徵說，目前看來，美國為了避免捲入戰爭，己經努力對陳水扁施加壓力，他相信在選舉過後，陳水扁很難抗拒來自美國的壓力。
張麟徵認為，既然國民黨陣營維持住立法院過半數席位，北京除了寄望美國之外，也希望泛藍在兩岸關係上，繼續阻擋陳水扁的台獨路線，張麟徵相信，雖然國民黨過去在阻擋台獨路線上，效果並不是太理想，但是能夠維持過半，至少讓北京可以放心一些，因此兩岸關係會維持目前相對穩定的僵局。