哥斯達黎加在清晨宣布和北京建交之後,台灣的外交部長黃志芳亦舉行記者會,宣布終止雙方外交關係,目前和台灣有邦交國家,祗剩下24個。黃志芳表示,他已提出辭職為此次事件負責。
總統陳水扁接受訪問時說,這次是非戰之罪,會全力慰留並且支持黃志芳。陳水扁指,根據情報顯示,哥斯達黎加先後和北京進行過四次建交談判,他說,北京給哥斯達黎加1億3千萬美元,另外還有3億美元買債券,陳水扁指,這樣的價碼,台灣真的出不起。
黃志芳表示,在五月底,哥斯達黎加外長去美國開會,台灣就懷疑判斷他去了北京。黃志芳說,他立刻派遣外交部次長前往該國,希望挽回邦交。哥斯達黎加外長,在香港時間清晨四點向台灣代表承認,他六月一號在北京,和中國外長楊潔篪簽署了建交公報。
副總統呂秀蓮說,她七月份將出訪巴拉圭,鞏固雙方關係。呂秀蓮預估,在總統大選期間,台灣的國際處境可能會遭遇更多外交打壓,而且通通都是北京的因素,她指,台灣唯一與主要的敵人,就是北京當局。