馬英九辭去國民黨主席後﹐國民黨週四開始競選新主席。有立委提出榮譽主席連戰回任﹐馬英九派系的立委計畫派代表參選。
馬英九因為擔心台北市長任內，涉嫌貪污首長特別費被起訴，依照規定辭去國民黨主席後，國民黨祕書長吳敦義，週四上晝張貼黨主席競選公告，訂出四月七日為黨主席補選投票日。
由於新任黨主席，將負責協調參加2008年總統大選的候選人，有意角逐總統大選的立法院長王金平，以及前黨主席馬英九，都希望對自己最有利的人當選。王金平派系，有意推舉一向對王金平友善的榮譽主席連戰，重新擔任黨主席。
王金平派系的立法委員許書博表示，將在星期五晚上，連戰從澳洲返回台灣時前往接機，要求連戰簽署參選黨主席同意晝，出馬角逐黨主席。許書博說：假使他能夠回來，對目前的狀況是特別好的，以他過去到現在的聲望，我想兩方面的人馬都可以來接受。
傳媒就報導，馬英九有意說服台中市長胡志強，或者桃園縣長朱立倫出馬參選主席，阻擋連戰回任。但馬英九就否認有這件事。馬英九說：我從來沒有跟他們去談過這個問題。記者問：你個人支持他們來選嗎？馬英九說：我覺得選舉，當事人本身要有意願。
馬英九派系立委賴士葆表示，不管誰參選，都要經過黨內的民主程序，不能說有人支持連戰，他就可以直接做黨主席，而毋需經過投票。(自由亞洲電台鍾廣政台北報導)