Báo cáo mới nhất về tôn giáo của Hà Nội đã công nhận rằng vẫn còn nhiều vấn đề tồn tại mà nhà nước phải giải quyết trong lãnh vực tôn giáo. Ông Lê Quang Vinh, viên chức cầm đầu Ủy Ban Tôn Giáo của chính phủ đã trình bày bản báo cáo trên trong một đại hội toàn quốc duyệt xét về tình hình tôn giáo của năm 1998, đồng thời đưa ra sắc luật mới cho năm 1999. Báo cáo của ông Lê Quang Vinh viện dẫn các lý do là nhiều cơ sở tôn giáo đã được xây dựng hoặc trùng tu một cách bất hợp pháp, đồng thời mâu thuẫn, tranh cải thường xuyên xảy ra liên quan đến vấn đề sở hữu các cơ sở tôn giáo này. Ngoài ra, còn có nhiều sinh hoạt và truyền bá giáo lý mà Hà Nội cho là trái phép. Báo cáo về tôn giáo của nhà nước Việt Nam do Reuters thu thập được còn cho thấy Hà Nội rất quan ngại trước sự bành trướng của đạo Tin Lành ở Việt Nam, nhất là trong các dân tộc miền núi người Hmong miền Bắc và các sắc dân thiểu số ở cao nguyên trung phần. Báo cáo của nhà nước Hà Nội còn nói rõ là ít nhất có một hai chính quyền cấp địa phương đã bắt giữ những người truyền đạo Tin Lành và buộc dân chúng phải cam kết không được đi theo đạo này.
