据香港明报报道，世界卫生组织驻华代表处透露中国内地曾经出现过甲型H1N1流感病毒变异病例，中国卫生部专家已证实。中国国家流感中心主任舒跃龙说，中国内地最早发现甲流病毒变异毒株是在今年6月，是一个从英国输入的轻症病例中分离到的；9月浙江医科大学和浙江省疾控中心分离到类似的病毒变异毒株，是来自同一个住院重症病例，目前这一病例已治愈出院。
香港卫生署23日也公布，在香港发现一宗甲型H1N1流感病毒变异。世卫组织驻华代表处新闻官陈蔚云也指出，就已知的信息来看，当前讨论的突变病毒与流行的甲型H1N1病毒差不多，没有表现出更加容易传播，也没有造成更多的死亡。目前全球已经有挪威、乌克兰、美国、墨西哥、巴西、日本和中国等7个国家报告了甲流病毒变异，不过是极少数的，而且这7个国家的变异都是同一种变异。