第一宗爆炸於周一早上七時過後發生，威力強大，巴士前半部損毀嚴重，左邊車身被炸穿一個大洞，兩邊玻璃窗完全粉碎，碎片散滿一地，車上當時載了三十多人，一名三十歲女乘客當場被炸死。
這部54路巴士，駛到人民西路潘家灣一個巴士站落客時，突然發生爆炸，住在巴士站對面大廈的居民呂女士，下午接受本台記者訪問時指，早上突然聽到兩聲巨響，初時還以為是打雷，其後才獲悉是巴士爆炸。她說：早上我下樓，才知道是公交車發生爆炸，當時大批公安及消防將車站附近的馬路全封鎖，公交車全被停駛，公安說是公交車上有外省人放了炸彈，是有計時的。有人被當場炸死，有十幾人被炸傷，都很嚴重的，北京將快舉辦奧運，那些人來搞恐怖破壞社會穩定。
呂女士又說，大批公安消防趕到現場搶救傷者，馬路上泊滿警車及救護車，中午過後巴士已陸續恢復行駛，但直至傍晚時份，部份路面仍然未解封，呂女士指，發生巴士爆炸後，短時間內都不敢坐巴士。她說：昆明市的治安一向都十分好的，我住這兒那麼久都不曾發生過類似事件，真令人無法想像會發生巴士爆炸的，現時好多人都不敢坐巴士了。
約一小時後，在昌源中路又有巴士發生爆炸，同樣是54路車，爆炸造成1人死亡4人受傷。
據新華網報道，第三宗巴士爆炸發生在岷山地段，但沒有報道詳細情形，三宗爆炸共造成兩人當場死亡，一人在送院途中不治，十三人受傷。傷者年齡最大為七十三歲，大部份傷及耳朵或受耳震蕩致耳膜破損，身體有多處外傷，十三名傷者被送往兩間醫院救治，現時仍有一名女傷者在急救中，其餘已沒有生命危險。市公安局人員到現場勘察調查後，指爆炸原因是有人蓄意將定時炸彈綁在前排乘客座位下引起的，公安機關已將此爆炸案定性為人為破壞案件，暫未知兇徒動機。
而中國公安部已派出刑偵專家組下午抵達昆明，協助當地公安機關調查巴士爆炸案，報道又指，事發前有乘客指，見到巴士上有可疑物體，在兩名男子下車後就發生爆炸。亦有目擊者指，巴士是在行駛中爆炸，濃煙很大，並有剌鼻氣味。
雲南省公安廳全面加強全省水陸兩路交通管制，又在進出雲南及昆明的主要通道設立關卡，截查可疑人士，邊防部隊亦在各口岸加強管控，防範疑犯逃出境外。
就巴士爆炸的調查進展，本台多次致電市公安局查問，但電話總是沒有人接聽，而記者多次致電昆明醫學院第一附屬醫院及雲南省第一人民醫院，查問傷者情況，但急診室的電話不是被佔線，就是沒有人接聽。