因民進黨敗選提出辭職負責的行政院長賴清德，及總統府秘書長陳菊周一（26日）宣布留任，賴清德指留下來是要穩定政局。國民黨台北市長參選人丁守中因些微差距落敗，周一提出選舉無效訴訟，指投票未結束就進行開票形同考試作弊。（鍾廣政 台北報道）
民進黨在周六（24日）舉行的「九合一選舉」大敗之後，行政院長賴清德和總統府秘書長陳菊先後辭職，獲蔡英文慰留。賴清德和陳菊周一宣布接受留任。
賴清德隨後在記者會道賀新當選的縣市長，並承諾會與每個地方政府合作，共同建設國家、造福民眾。
賴清德說：選舉已經結束，每一張選票固然是對政府很深的期待，同時也是對施政的檢驗，選舉的結果對施政是不滿意的。因此，我第一時間除了表達道歉之意以外，也向總統口頭請辭。昨天下午，我也跟總統進行討論，我最後決定留下來繼續努力。一方面是希望行政院的政務推動不至於終斷，也希望能夠協助穩定政局。
國民黨書記長曾銘宗表示，這次選舉是蔡英文的期中考試，不合格代表民眾對政府的兩岸以及其他施政不滿。他指出，依照法律蔡英文只負責兩岸、外交和軍事政策，其他都是行政院職權，所以賴清德應為施政不佳下台負責。
國民黨台北市長參選人丁守中，原宣布周一派工作人員前往台北地方法院，繳交4百幾萬新台幣保證金，要求重新驗票。
但他的競選辦公室發言人丁為元和律師抵達法院後，卻改變抗爭策略。
丁為元說：我們今天來到台北地院，主要是要撤回重新驗票的申請。主要原因是驗票矌日廢時，這幾天我們接到很多人對中選會違法亂紀，漫無章法的事證以及證據資料，所以接下來我們會直接按照選罷法第118條，提起選舉無效之訴。
丁守中律師周國代表示，有充份證據顯示這次選舉過程對丁守中不公平。
周國代說：我們現在要做的準備，就是陸陸續續收集了很多資料，我們必須要經過很慎重的過濾。因為在法律上的攻防，你們看到有選民拿選票出來的，其他的我們在攻防的策略與戰略恕不奉告。
丁守中競選總幹事王育敏表示，根據過去經驗，驗票都無法改變選舉結果，這次選舉最重要是選舉過程邊開票、邊投票，丁守中陣營決定直接採取訴訟方式，要求法院決定台北市長是否要重新選舉。
王育敏批評，投票截止後因為排隊人龍太長，中選會決定給民眾繼續投票，並同時進行開票。就等於排隊考試的學生，未進入考場前就有人宣讀答案。王育敏指，由於選舉機關安排不當，民眾要排超過一小時才能投票，導致好多長者中途離開沒有投票。
爭取連任的柯文哲在選舉中只領先3250票，台北市沒有投票長者約1萬5千人，如果依照民調，這個年齡層有6成支持丁守中，就有9千票差距，對選舉結果絕對有影響。