台灣第二次武漢撤僑包機的乘客周三（25日）結束14天隔離出關無人感染，乘客除了感謝外還希望再派包機，接回仍滯留武漢台灣人。前總統馬英九也發表聲明，呼籲以人道考慮撤消對在武漢台灣人的禁止入境限制，但衛福部長陳時中仍堅持包機優先，並指等武漢解除封城後還要再觀察。（鍾廣政 台北報道）
3月10日，由華航和中國東方航空接回第二批滯留武漢台灣人，乘客隔離14天後，周三（25日）清晨獲准返家。一位大陸配偶對隔離措施表示相當滿意，稱讚台灣的防疫工作做得很好。
大陸配偶說：我心情太激動了，此時此刻我真的是萬分的感謝，感謝台灣的政府，感謝陳部長（衛福部長陳時中），感謝所有的醫護人員，所有的媒體給我們最大的幫助和鼓勵，感恩感恩，你們辛苦啦！過得很好，在吃的、住的、警衛、醫護人員都日夜的為我們服務，很親切，真的很親切。
也有隔離乘客表示，希望政府能派出第三次包機，接回滯留武漢幾個月的小孩和孕婦。（應要求聲音經過變聲處理）
乘客說：他們在那邊已經很久很久了，我特別能體會他們滯留的心情，當時我還在那邊的時候，每天都很焦慮和鬱悶，每天都吃不好睡不好，很想念台灣的家人。就我所知，現在在那邊的還有一百五十幾位小朋友和一些孕婦，他們日子肯定過得不是很好，就是孕婦不能產檢，小朋友也不能上學和家人團聚，希望政府能夠盡快把他們接回來，我們回來了，他們也想回來。
陸委會對於本台詢問第三次包機進展，沒有回應，表示由中央流行疫情指揮中心負責。
陸委會副主委邱垂正，早前在立法院被傳媒追問時，也沒有明確答案。
邱垂正說：對於湖北接返人員的健康安全，以及我們整體防疫的考量，我們還是遵照指揮官所作出的管理措施，就是用包機的形式回到台灣來，然後才能夠集中檢疫和接下來的後續措施。我們還是會依照防疫第一、弱勢優先、量力而為的三原則以及過去兩次包機的經驗，持續與陸方溝通協調。
中央流行疫情指揮官陳時中表示，當時因為武漢封城有高風險，移民署對在武漢的台灣人註記身分，不得自行搭機返台，必須乘搭包機。至於武漢四月八日解封和解除註記是兩回事，解封是指大陸的民眾可以自由移動，解註記是代表風險是否存在。
陳時中說：我們還是需要有一點觀察期，觀察到底這樣一個真正內部的風險，到底跟整個世界的風險是不是相等同，或者更好或者更差。所以為了謹慎起見，我們認為還是有註記上的必要，但是我們應該是，他們有這樣的宣布我們就有這樣的因應，就是說怎樣在這個觀察期裡面，要怎樣更有秩序來管理這個東西。所以在這個觀察期裡面，我們方向上還是以包機為主。
前總統馬英九發表聲明呼籲，政府若無法促成第三次包機，就應立即解除滯留湖北台灣人的身分註記，撤銷「黑名單」，讓他們可以自行搭機返台。
馬英九指，隨著全球疫情益發嚴峻，歐美成為台灣境外移入病例的大宗，但海外台灣人與領有居留證的外籍人士仍可回台，唯獨滯留湖北的台灣人受到限制。
馬英九稱「希望行政院長蘇貞昌多一點同理心」，不要再讓無辜的台灣人因政治考量而受苦，讓他們能夠儘快回來，才應是政府的最重要考量。