中國將於兩天後開放港澳台人士申辦居住證，台灣獨派團體批評，大陸企圖藉居住證強化「台灣是中國的一部分」，不滿民進黨政府至今仍沒提出反制措施。學者警告台灣人申辦居住證後，不僅有稅務上的風險；還可能因在台灣批評北京後，過境或停留在中國邦交國時，被北京要求遣返大陸追溯法律責任。（鍾廣政 台北報道）
中國批准在大陸居住的港澳台居民，從周六（9月1日）起可申請大陸居住證，並享有中國公民的各種福利。獨派團體台灣教授協會批評，蔡英文政府對中國一再出招無所作為，明顯失職。
協會副秘書長陳俐甫認為，台灣應由被動轉為主動，在不同層面作出反擊，效果可能更好。
陳俐甫說：我不跟你在同一個水平和面向鬥爭，你要玩居住證我就跟你玩聯合國，如果你要再斷交我就在國際上改名，因為我這個玩不過你我就玩別的。我覺得這是政府要考慮的，不能一直追隨中共做防守，這其實是完全沒有國際政治的訓練。我們的國家安全不但不了解中國統戰的做法，連基本國際政治鬥爭的邏輯都很欠缺，我覺得這才是最令人擔優的事情。
台灣戰略模擬學會研究員何澄輝表示，居住證措施用惠台糖衣包裝，民進黨政府放任中國單方面說詞，放任中國散播有利於對台掌控的片面言論，置台灣民眾與社會於風險中。
何澄輝說：如果一旦你申請了中國的戶籍之後，你就成為中國稅法上課徵的對象，特別是他們即將要通過的稅法修正案當中，對於中國公民以及有中國戶籍的居民，全球的所有財產都必須要課徵賦稅，特別是個人所得稅的部份。而不管你在中國境外包括台灣的所有財產所得，通通都是他稅捐的課徵對象，台灣跟中國政府短期之內不可能談到租稅協定。
美國加州大學爾灣分校法律社會學博士沈伯洋表示，中國在國際營造台灣孤立，並在經濟上使力，逼迫台灣人表態，政府如果沒清楚告知民眾，民眾可能因為生活需求，自然而然走上中國鋪設好的道路。沈伯洋更擔心，申領了大陸居住證的台灣人會誤墮法網。
沈伯祥說：像各位與親戚上或商業上的往來手機上都裝了微信，你在微信裡面討論中國民主化的問題，你即使人在台灣，他可以跟你講因為伺服器在中國，所以你等於在中國犯罪我有權逮捕你。我們當然覺得沒甚麼，解放軍不會直接跑來台灣把我們抓走。但比較嚴重的是你如果出國呢？假設你今天去肯亞，去其他跟中國有司法主權協定地方時，他可不可以在第三個國家主張你在微信上發了一些中國民主化的東西，而且有內亂的問題所以把你逮捕。
英國牛津大學博士候選人宋承恩表示，居住證措施越過台灣主權，以生活便利等小利，模糊台灣人與中國人的界線。
宋承恩說：我拿中國發的證明在國際上使用，各位知道如果在北京跟上海轉機他要看台胞證，他盡量極大化這個機會讓台灣人出國要帶台胞證。現在很多年輕人常常在網路上問，出國要不要帶台胞證。久而外之大家會習慣我的護照不夠，我上面還有一個政府他發給我一個證件我出國要帶，這是甚麼意涵？我們如果再回來思考，他是去主權，否定台灣是一個國家，並且要把台灣港澳化。
宋承恩指出，居住證不僅是受監控或個資風險，而是主權問題，台灣政府若不積極自保，有可能會被邊緣化，若不作為，就是坐視主權流失。