在台灣，總統蔡英文就港府拒絕台方人員，赴港押解陳同佳的決定回應表示，台灣不會放棄司法管轄權。陸委會批評港府拖延移交，讓凶手逍遙法外應負擔一切後果。但學者認為港府是以法律為基礎政治操作，而台灣是不斷扭曲和忽視法律操作政治。（鍾廣政 台北報道）
蔡英文總統表示，陳同佳案的加害人與受害人都是香港公民，但既然香港政府不願意行使管轄權，替受害的香港人伸張正義，就由台灣來處理。台灣不會放棄管轄權。
蔡英文說：案件的凶手已經是我們所通緝的對象，所以是一個受通緝的凶嫌，所以在這個案子，沒有所謂的「自由行背包客」的問題，只有逮捕，沒有自首的問題。
陸委會副主委邱垂正發表聲明表示，港府在整個處理過程中，先是故意放棄自身應有的管轄權，又漠視台灣提出的請求，刻意拖延時間，不將嫌犯移交給台灣，甚至公然主張讓嫌犯自行搭機前來台灣，完全無視同一班機旅客的安全，只為達成讓疑犯「自首」的政治目的及安排，讓香港成為殺人犯可以到處行走的罪犯天堂，令人匪夷所思。
邱垂正說：我方重申，政府自去年初本案案發以來，為彰顯本案公義，還給受害家屬公道，已用盡最大努力，展現我方願與港方共同合作的高度誠意，但港方完全無視，更操作推動害人害己的「送中條例」，港人不滿及憤怒至今未減，現再拒絕我方合作的請求，我們要正告港府 ，一切惡果，都應由港府承擔。
對於香港特區政府在周三（23日）凌晨發表聲明，表示台方應取消對陳同佳的入境管制，以免令通緝令自相矛盾的講法。內政部次長陳宗彥反駁話，港府的說法不符事實，但強調陳同佳仍有方式可以申請入境。陳宗彥指，由於台方必須掌握陳同佳的行蹤，因此需要禁止陳同佳與預定陪同人員的網上簽證，如果陳同佳真心要來台接受法律制裁，就必須到台灣駐港辦事處申請簽證，並非限制陳同佳入境。
台灣政治大學法律學院副教授廖元豪表示，台灣人民力量迫使政府轉向，如果社會沒有壓力，民進黨才不會理國民黨，馬英九昨天公開大哭都沒用，就是因為社會無法接受，民主力量才迫政府轉向。
廖元豪說：我們可以看到香港政府的政治動作，是跟法律結合得非常緊密，他通通符合他們的法律，也符合台灣的法律，在這個法律架構下去做政治行動。但是台灣卻不斷去忽視法律跟扭曲法律，甚至放棄主權。到今天早上陸委會還在瞎扯，陳同佳放出來香港放殺人犯，趴趴走跑來跑去，這是香港政府要負責。已經再三的強調，香港也已經強調，在香港沒有辦法起訴陳同佳殺人罪。
台北市長柯文哲，被傳媒追問民進黨政府拒絕陳同佳自首，決策是否轉軑？柯文哲表示，因為輿論反對，這就看報治國，民進黨的中心思想叫「民調」。
柯文哲指，這就是典型把司法當政治工具，但也沒辦法，蔡英文政府平常都會這樣做，何況總統大選要到了。
對於如果陳同佳自己赴台，不是由台灣的司法官員帶回來，是否會陷入陸委會講的「一中框架」？柯文哲嘆一口氣說，人家說從政不難，找回良心而已，執政也不難，就莫忘初衷。