中国大陆海峡协会会长陈云林星期五结束在台湾的五天访问，上午十点钟搭机离开台湾。在离开台湾的欢送仪式上弦外有音地临别赠言，说他期待不久将来，有更多台湾朋友到大陆参访、旅游，大陆方面会热情欢迎。而且这些台湾朋友到大陆旅行将会到处都是「一片和谐、一路春风」。现场媒体都露出会心微笑。
陈云林首先表示，这一趟台北之行，完成了两岸同胞期待已久、交给海基会与海协会的光荣使命。五天前，他带着大陆十三亿人口对两千三百万台湾同胞的深情厚意而来，今天也将带着两千三百万台湾同胞对大陆同胞的深切友情、理解和支持离开台湾。
陈云林强调，尽管未来的路还很长，很可能会遇到「这样、那样的困难」，但一定会有所担当，两岸两会将不负两岸期待，为两岸同胞继续做出有利于共同利益的事。
陈云林特别对这几天辛苦的维持治安的警察表示问候，说他们「从凌晨到深夜，从激烈抗争，头上留下的鲜血」，除了表示謝意，还当场深深一鞠躬。
陈云林在致词结束之后，跟海基会送行人员一一握手道别。在接受献花之后，立即搭车前往桃园国际机场。
海基会董事长江丙坤在欢送陈云林的仪式上表示，这次台北会谈成果豐硕。并且还例举最新出炉的民调作佐证。他认为，民调数据显示海基会的努力没有白费，因为这是攸關人民福祉的工作。未来海基会会继续努力，终极目标是两岸和平、经济双赢。
根据台北市政府警察局的最新统记资料，陈云林在台湾五天期间，到星期五早晨七时三十分为止，一共有一百四十九名警察受伤。也就是说，为了保护陈云林，台湾警方平均每天有三十位警察受伤。
自由亚洲电台胡汉强台北报导
在中国大陆海协会会长陈云林离开台湾不到数小时，总统马英九立即在台湾一家电视台专访时坦承，双方对称呼他为「总统马英九」有分岐。马英九认为，在双方对称呼都没共识时，保持这样也没什么不好。马英九强调，陈云林这次来台，很重要的意义就是互不否认，能做到这一点，两岸关系又能往前迈进。
马英九说，过去都是台湾方面的人去大陆，这次第一次有外电形容是最高阶层的大陆代表来台，其中很重要的意义就是互不否认。
马英九还透露，对于星期四他决定将接见行程提早五小时，整个接见过程不到十分钟，是获得海协会访客的同意，双方对这个决定有共识。
对于民进党发动的「围城」游行爆发流血冲突，台湾的媒体民调显示民进党主席蔡英文要负最大责任。马英九表示同意。他说因为当初蔡英文曾说过会理性和平。他批评蔡英文说，「蔡主席选择一条她不熟的路，采取一些她不擅长的事情，得到一些她想不到的结果，满可惜的。」
马英九认为，不能把群众动员来，造成事端、伤害、流血、暴力，然后说这不是我们的人。
对于警方在执行保护海协会会长陈云林的安全工作时，执法过当、规格过高的批评，马英九认为，这不是规格高低问题，是任务需要，陈云林来台湾访问，和过去接待外宾并没太大差别，但因民进党要「如影随形」、还说有十八套剧本、要丢鸡蛋等等，令警方非常紧张。尤其是张铭清被殴打的事件之后，使马英九决定，宁可警力充裕，避免这些事情。
自由亚洲电台胡汉强台北报导