国台办主任张志军访台期间抗议不断，且强度愈来愈高。这导致张志军访台最后一天行程中，原订和台湾民众接触的行程全部取消。
张志军的访台行程从周五进入本土意识强烈的南部起，不仅抗议不断，而且强度愈来愈高。
周五白天，反对者多半以聚众喊口号、打横幅的方式表达抗议。但到了晚上，张志军的车队突然遭到「伏击」。包括学生在内的多名抗议者，突然向车队及随扈人员扔出装着白色油漆的塑胶袋，张志军本人虽然没有被砸中，但不少警卫人员都被扔得满头满脸。
张志军周六的行程原本包括参观高雄前镇渔港、台中雾峰林家和出席彰化鹿港天后宫庙会活动。但面对不断升高的抗议行动，国台办和陆委会在周六凌晨宣布取消前镇渔港和雾峰林家的参访，并且以「周末高铁人潮众多」为理由，取消了张志军搭乘高铁的安排，改为全程搭专车。
取消了前两项行程，却仍然保留参加鹿港天后宫的庙会。这使得中午之后，大批抗议人士开始往天后宫集结。民进党籍彰化县议员梁祯祥的儿子梁伯洲就在现场与庙方工作人员发生肢体冲突，被打得血流满面。眼见抗议张志军的人士和庙方的对峙愈来愈激烈，陆委会和台办再次宣布取消张志军的行程，改由国台办交流局长程金中代表出席。
原订四项行程取消了三项，张志军最后只剩下和台中市长胡志强参访「惠明盲人学校」。在这裡，他总结了这趟台湾访问行程的心得。
张志军说，这次除了进一步确认两岸事务主管的联繫沟通机制外，也很高兴有机会参访许多地方、见到了许多人。张志军也说，各界对两岸关係和平发展所取得的成果具有广泛的共识，得到社会广泛的认可。「所以大家也都表明一个愿望，也就是希望两岸携手，一起继续两岸关係的和平发展。」
张志军也说，这趟台湾行让他印象最深刻的，是儘管两岸关係这段时间遇到一些问题、出现一些情况，但两岸关係和平发展仍是最大共识。张志军再次提及自己在佛光山许下的心愿，希望两岸透过亲情与智慧化解心结，逐步解决两岸间尚存的问题与差异。
张志军在下午三点抵达桃园国际机场，依照原订行程搭乘六点二十五分的班机离台。他在机场被问道对于此行沿途抗议不断，会不会感觉台湾方面欠缺礼貌。张志军回答「这个问题大家可以做出判断」，台湾是多元社会，有不同声音，但声音应该要用什麽方式表达，更应该由台湾民众自己去考虑。
记者：李潼/责编：马平