天网义工张建平在20号的一封呼吁书中表示，当局非法拘捕黄琦的理由是：他“涉嫌非法持有国家机密”。张建平说，天网的人权报道确实在去年“引用和转载过一些内部文件之类的东西”，但是这些东西算不上是国家机密。
山西维权人士邓太清也表示，内部文件算不上是国家机密：
“我理解的国家机密是一些军事机密，或者涉及到国防外交的机密，这些算国家机密。如果就是一些地方政府对具体事务的规定，他一般都打印是内部文件、不让往外传，但这种东西算不上国家机密。比如一个市里面的一个局，它也可以发个文件啊，这个文件是局内部有关人员看的，但这个东西不算国家机密。”
邓太清认为，拘捕黄琦的真实原因是：一些地方政府早就视黄琦为眼中钉，汶川地震发生后当局更是害怕他和天网的维权活动影响灾区稳定：
“这个就是黄琦和六四天网在的时候，不断通过各地义工收集各地一些地方政府的不法行为，向国际社会和国内社会曝光。那么，有些地方政府非常恼火，也有所顾忌，所以对黄琦恨之入骨。这一次借着汶川大地震需要灾区的稳定，以这个理由，地方政府就把黄琦抓起来。那么，这就在中国维权方面可能就少了一个强有力的发声的地方。”
北京维权人士徐祥也对所谓黄琦持有国家机密的指控提出质疑：
“如果黄琦确实涉及到了国家机密、危害到了国家安全，抓他是应该的。但是，如果他涉及不到，以莫须有的罪名抓他，中国人民不会答应，世界人民同样不会答应。据我个人了解，机密、秘密、绝密分三级，作为一个内部文件来定他黄琦泄露国家机密、危害国家安全，这个值得商榷。我感觉黄琦，我以前登录外国新闻网上，对他这个网站和个人有一部分的了解，他并没有官方背景，也不是公务人员，从何而来所谓的国家机密文件？如果黄琦能拿到国家机密文件，那么，我们的国内部门是不是有渎职？”
天网义工张建平在公开信中引述了中国领导人胡锦涛所说过的“公民有知情权、参与权、监督权、表达权”；徐祥则提到胡锦涛最近对网友们的问候。他们希望中国政府本着开放精神，还黄琦以公道和自由。徐祥说：
“我感觉如果黄琦没有其他事，就单单这点事的话，我想当局应该给他一个说法，而不能因为这点事要给我们中国维权界一个信号。这也是我们的一种猜测。但是，我从胡锦涛先生在两天前通过人民网强国论坛向全中国乃至世界网友问候的几句话，我看到了一种大势所趋。我还是感觉我们的政府能给予黄琦这样的人一个公正、一个公平、一个自由。“
这是自由亚洲电台记者杨家岱的采访报道。