清晨还不到五点，总统府前广场上就挤满了人，等着进入会场参加升旗典礼。不少民众围着筹委会特别製作的红、蓝、白三色的限量版围巾，手拿着青天白日满地红旗，说说笑笑地进场，还不时停下来，以总统府为背景，拍照留念。
一位空军退役老伯，拿者一根长长的钓鱼竿，串起了十多面小旗，除了青天白日旗外，还有台湾光復纪念旗、中央军校校友会旗，每一面都格外珍贵。问他对百年元旦的感想，他说，这一百年，经过多少风风雨雨，能走到这裡，很不容易，所以今天让人特别高兴。
升旗典礼开始前，筹委会安排了许多表演：先由一群小学生带着全场民众一起做健康操；接着由李建復、许景淳、彭佳慧和施孝荣四位台湾歌手，分别以普通话、闽南语、客家话和原住民语，演唱四首歌曲，象徵台湾四大族群融为一体。在演唱的同时，会场大萤幕还播放一部纪录片，从辛亥革命、召开国会、北伐、抗战、政府迁台、总统民选，政党轮替，一幕幕影像，纪录着百年民国的重要场景。
在三军乐、仪队的表演结束后，马英九总统偕同夫人周美青一同进场，升旗典礼正式开始。
典礼结束后，马英九接着发表讲话。他说，一月一日，全世界都在庆祝新年，但我们的感受特别不同，因为大家有幸在这裡见证民国百年元旦，这个历史的重要里程碑。
马英九说，一九一二年，国父孙中山先生宣示中华民国成立。回想在清光绪二十年，一个二十八岁的年轻人，在遥远的美国檀香山，组成了兴中会。会长是一位银行出纳员，会员有中餐馆老闆、洗衣店老闆，当时任谁也没想到，十八年后，他们一举推翻五千年帝制，成立了亚洲第一个民主共和国。
马英九也说，民国创立之初，风雨飘摇，前途未卜，但国家一步一步走到今天，一百个年头，昂然站在世界上，成为华人世界中政治最民主、经济最繁荣、教育最普及、思想最多元的国家。此时，回想先烈们的付出，这是个感恩的时刻。
马英九致词结束后，还有一场重头戏，就是有一百对新人的结婚典礼，他们列队在观礼台上，由马英九担任证婚人，副总统萧万长出任介绍人，在全台湾人民面前，完成终身大事。马英九除了祝贺新人百年好合，勉励他们孝顺父母，敬重长辈外，最重要的就是努力「做人」，生生不息，为国家培育优秀的下一代。
自由亚洲电台李潼台北报导