在这次选举中，国民党赢得十二席、民进党四席、无党籍一席。民进党夺下了具有指标意义的宜兰县，得票率上升到45.32%。国民党主席马英九坦承选举结果不如理想，将检讨改进。不过马英九回避采用「败选」两字。民进党主席蔡英文认为，「民进党已走出谷底」。
马英九晚间在国民党中央召开记者会，他认为这次国民党席次与得票率都不如理想，但在当前经济不景气，失业率高情况下，选民还给国民党在十二个县市执政的机会，非常宽厚，国民党一定抱持谦卑与感恩精神，面对这次选举传达的警讯，落实提振经济，兴利除弊，让人民生活过得更好。
对于媒体质疑，国民党在宜兰县失守、花莲县大幅输给脱党出走的国民党员，是否代表「马英九光环」消退？马英九回应表示，选举成败不是单一因素决定，候选人、大环境以及政党辅选都有影响，选举结果是所有因素整体运作综合的结果，对于找得到的原因，国民党都会努力改进，彻底检讨。
马英九特别强调，花莲选举结果清楚传达国民党给社会的讯息，国民党的核心价值要坚持，不能提名违反廉能原则的人参选。
马英九在整场记者会用了九次「大环境」，但是从没出现「败选」两字。
在三合一选举结果揭晓后，民进党主席蔡英文表示， 这次选举民进党执政的三县市云林县、嘉义县、屏东县连任成功，并夺回民主圣地宜兰县。 而且还获得历届县市长选举最高得票率45%，结果令人欣慰。她宣布，「民进党已走出谷底」。
蔡英文特别强调，扣除二零零四年总统大选，民进党这次得票率达45%，史上最高，代表人民愿意再给民进党一次机会，民进党已走出谷底、站稳脚步，民进党将在坚实基础上重新出发。
蔡英文认为，民进党在宜兰能重新执政意义重大，代表民进党重新获得选民信任，民进党也重新找回信心。这次选举另一意义是「人民对马政府投下不信任票」，无论国民党如何将选举与政绩切割，但国民党席次不进反退，代表政府施政悖离民意，未来政府施政不思改进，未来人民将有更大反弹。她期盼国民党能够重新检讨施政。
这次台湾的县市长、县市议员、乡镇市长三合一选举在星期六下午五时投票结束，全台六千三百八十四个投开票所同步开票。县市长选举投票率63.34%，略低于四年前的66.22%。
另外，根据法务部公布的查贿绩效统计，各地检察机关共计起诉七十九人，羁押一百七十四人。其中花莲县光复乡三名乡长候选人，全因疑涉贿选遭羁押，创下花莲乡镇市长选举有史以来的新纪录。
自由亚洲电台胡汉强台北报导