台湾分别于周日和周一（29、30日）以定期航班的方式，将滞留湖北省的三百多名台胞取道上海返台。陆委会主委陈明通向中方表达感谢。两岸政策协会认为，台湾当局强调使用「武汉肺炎」字眼，会破坏两岸互信。台北市长柯文哲指，台湾对大陆和欧美采用两套不同的检疫标准，会影响两岸关系。（锺广政 台北报道）
台湾周日和周一先后透过华航定期航班，从上海接回早前滞留湖北的三百多名台胞。
陆委会主委陈明通周一，对于能促成今次撤侨，向大陆方面表达感谢，但他强调，这并非撤侨包机。
陈明通说：这个跟武汉包机是一码归一码两件事情，所以不要说第一次、第二次、第三次这样顺位顺下去，性质上不一样。武汉的包机，那边四月八号解封，解封后飞机能不能飞等等还有很多变数，所以就武汉的包机我们还保持协商当中，没有进一步对外说明。湖北解封的县市，你看到我们就是用指定航班、指定地点，现在指定上海请他们坐这班飞机回来。最重要是防疫的措施，大家都看到非常的严谨，按照我们疫情指挥中心的要求，做得非常严谨。
两岸政策协会就新冠肺炎和两岸撤侨包机成功，是否能进一步改善两岸关系举行座谈会。
两岸政策协会秘书长张百达认为，两岸共同敌人不仅是病毒、疫情，还包括双方各自内部的仇恨政治、极端政治与民粹主义。这不仅对台湾民主发展是相当负面的，就两岸关系也是负面的。张百达指，尤其台湾当局和政府高官使用「武汉肺炎」的歧视性字眼，影响两岸关系发展。
张百达说：我想这需要将心比心，这四个字一开始完全没有歧视的意思，包括中国大陆的媒体、官方也是这样使用的。但是当WHO依照过去2015年一些相关国际组织命名的规范，认为那样是具有歧视性的用语，建议停上使用之后，我觉得台湾政府应该跟著全面停止使用，特别是我们要争取加入包括WHO在内任何国际组织，这是国际的共同共识的话，我们应该要遵遁。停止使用也是对大陆释放善意，也是表达台湾文明进步的一种价值，包括遵循国际进步的规范。
民进党前主席许信良表示，美国国务卿蓬佩奥在七大工业国会议（G7）坚持要用「武汉肺炎」来写公报，但其他国家都反对。美国总统特朗普过去为了刺激中国大陆，特别讲「中国肺炎」，他也是为了报复中国外交部发言人，指控新冠肺炎来自美国。这是为了报复的气话，现在特朗普也不再使用这个名称。
许信良说：其实台湾应该支持全球化，我们也希望加入WHO，所以我们对于全球的共识应该特别敏感。我们既然想加入WHO，所以WHO定的名称，对全世界除了美国之外大多数人都接受的共识，我们应该很在乎，应该很尊重。在两岸关系里面，我们也没有必要特别去刺激中国大陆。中国大陆既然很在意武汉肺炎，最初他自己也称武汉肺炎，现在既然他在意，认为是歧视的名称，所以我想两岸关系互相尊重是非常重要的。
台北市长柯文哲认为，大陆回来的台湾人，像是今次的上海包机，全部要关在同一地方集中检疫，但是欧美回来不需要。他指，现在统计数字来看，纽约比武汉还危险，所以应该要有统一的标准，不管是对中国抑或对美国，要恢复到科学的根据，就是该怎么做就怎么做，标准一样。
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