台灣外交部駐日本的代表許世楷是原陳水扁舊政府的代表，在新政府上台之後，部份駐外人員並沒有更換。這位駐日本代表許世楷原是台獨運動者，是“深綠”人士，而非常具有諷刺性的是他擁有日本居留權，在這次的事件上，他表現出十分媚日，甚至在事情獲得解決之後他便會請辭，然後返回日本，他在這次釣魚台事件上的態度與立場是非常曖昧，目前他已經辭職。
目前，台灣政府內一些“綠色”背景或民進黨的人都紛紛請辭，不然新政府也可能會換人。最近，民進黨也於中央政策會中，提出要求那些民進黨員以及與民進黨關係密切、目前正在當官的人，最好是辭職，因為不要幫國民黨揹黑鍋。所謂“一朝天子一朝臣”，但是馬英九在上台之後，為了安定，他只是更換了內閣的主要成員，至於其他如副部長、公營機構的董事長…等還沒有更換。
而這次的釣魚台事件在島內也引發起朝野的鬥爭，目前民進黨要當好反對黨，於是對於國民黨的一切一定會無對不反，特別在而這次的釣魚台事件上明顯地表現出並不是為了捍衛主權，而是為了打擊國民黨的威信。雖然目前馬英九已經把事件處理了，也得到日本官方的道歉，但民進黨就認為他前倨後恭、先軟後強又或是先強後軟，總之他做什麼都是不對的，當然這也是反對黨應有之義，就是要批評執政黨。
在釣魚台主權的問題上，台獨人士跟國民黨的執行者之看法是完全不同的。中華民國聲稱擁有釣魚台的主權，其行政區劃是歸宜蘭縣的，一直以來中華民國政府對於釣魚台主權的立場是非常清晰的，但是民進黨政府是只談漁權，不談主權，因此從這次的事件可以看到，台灣意識形態的鬥爭對於外交的層面也會有影響，而台灣的政治問題難以得到真正的解決以及進一步發展民主有所困難，都是受到意識形態鬥爭的影響。
至於中共方面，在這次的釣魚台事件上的態度讓人感到非常失望，她表現出十分遲疑。不過，後來外交部的姜瑜也發表了聲明要求日本停止在釣魚台海域的非法活動，但是這不禁叫我們要去問，為何日本可以在釣魚台海域附近進行所謂的非法活動呢？而我們又表現奈何呢？為何在釣魚台的海域有日本的艦艇，但沒有中國的艦艇呢？整天都說要捍衛釣魚台的主權，但事情為何弄成這樣呢？這些都是很值得中國人再三去思考。