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海協會會長陳雲林，週四下晝預定乘坐遊艇到日月潭遊覽。警方為怕民進黨人士抗議，在各個碼頭把守，嚴格檢查要遊湖的旅客，就連法輪功人士，也被阻隔在一公里以外的岸上。
不過，當二十艘大小遊艇和記者船，圍住海基會和海協會的遊艇出發後，才發現陳雲林無上船。
很多記者在船上，向海基會董事長江丙坤的遊艇高叫，質問為什麼陳雲林沒有來，也有人不斷高叫係騙局和台獨口號洩憤。在傳媒追逐下，海協會副會長李亞飛解釋說是親民黨主席宋楚瑜突然想見陳雲林。李亞飛說：今天下午是這樣的，宋楚瑜宋主席他趕過來，作為老朋友要跟陳會長見面。陳會長當然不能不理，所以我們把時間調整了一下，跟宋楚瑜這位老朋友見面，所以未能夠去遊湖。
陳雲林上晝先參觀南投縣中台禪寺，之後再到水里一處在八八水災中，被沖毀的道路參訪。陳雲林說，在水災發生後，好多大陸同胞向他表達關切，希望能盡力幫忙。陳雲林說：向廣大的台灣災區同胞，表示大陸同胞對他們的深情問候和良好祝願。祝願和深情的希望他們能夠自力更生，在各方面的幫助和努力下，重建自己的家園。
至於周三晚的泡血事件，源於有示威人士在陳雲林入住的裕元酒店外燃花巨型煙花，一名警員制止並準備拘捕示威者時被人從宣傳車上推落地，頭部撞地流血不止動彈不得。被送往醫院急救後恢復清醒，但因腦部出血須留醫。警方在現場拘捕六名涉案男子。內政部長江宜樺指，警方將依違反公共危險罪，妨礙公務及傷害罪，將六人移送台中地檢署繼續偵辦。而民進黨澄清，被捕的6人都不是民進黨員。
陳雲林週五返回北京前，會發表離台談話。