廣深港高鐵香港段正式通車前一天，香港特首林鄭月娥及廣東省省長馬興瑞，在高鐵西九龍站主持開通儀式，並試乘列車前去廣州南站。所有獲邀的立法會泛民議員都杯葛儀式，而有政團在站外示威，抗議「一地兩檢」破壞一國兩制和香港法治。（劉少風 報道）
廣深港高鐵香港段開通儀式前，民陣及社民連十多名成員，周六（22日）在港鐵九龍站前往高鐵西九龍站的通道示威，向出席嘉賓遞交請願信，其中全國人大常委譚耀宗到場時被示威者包圍，場面一度混亂，有多名警員在場戒備，不少嘉賓要在職員護送下才可進場，有示威者試圖衝破防線被多名港鐵職員制止，按在地上。社民連其後在社交網發文指，副主席周諾恆多次被推撞、成員陳文威亦被保安強行拉倒地下及毆打。
一地兩檢關注組及民主派議員約二十多人，在西九龍站旁的柯士甸站外示威，指「一地兩檢」破壞香港法治，批評高鐵工程耗用大量公帑，又出現質量問題。他們高叫口號，呼籲市民在10月1日國慶日遊行抗議。
一地兩檢關注組成員譚凱邦表示，內地執法部門可以在香港境內執法，是破壞一國兩制，呼籲市民不要乘坐高鐵。
譚凱邦說：既然高鐵不合法，是破壞一國兩制，便不要乘搭，第二就是，林鄭月娥或政府經常說，一地兩檢是香港人想要的，對不起，一直只是建制派及政府吹噓這條高鐵是香港人想要，而不是真正香港人想要。
高鐵香港段的通車儀式，由特首林鄭月娥及廣東省省長馬興瑞主持，出席的嘉賓包括政協副主席董建華及梁振英、港澳辦主任張曉明及中聯辦主任王志民等四百多人出席。
林鄭月娥致辭時稱，香港加入國家高鐵網絡，象徵新時代來臨，又指高鐵香港段只有短短26公里，卻令香港接通國家三大經濟圈，創造更多發展機遇。
林鄭月娥說：高鐵香港段能夠以最高效能的開通，利便兩地（粵港）人民，落實「一地兩檢」這個創新安排，最為關鍵，我要衷心感謝全國人大常委會，為安排提供堅固的法律基礎，以及立法會議員，尤其是立法會主席梁君彥議員，及法案委員會主席葉劉淑儀議員，適時通過「一地兩檢」的本地法律。
而馬興瑞表示，高鐵香港段開通，是粵港澳大灣區建設的重要里程碑，更有利粵港合作。
馬興瑞說：廣深港高鐵香港段正式開通，標誌著香港與國家高鐵網實現無縫對接，大大縮短香港與內地時空距離，使香港與廣州、深圳融入一小時生活圈，必將為粵港兩地居民開展商貿合作、旅遊觀光、探親訪友，提供更加方便、便捷和舒適服務，為粵港合作提供更有利支撐。
開通儀式後，林鄭月娥與各主禮嘉賓參觀西九龍站設施，先經過香港入境處的出境設施，其後跨越黃線進入「內地口岸區」，大批內地邊檢人員迎接。
林鄭月娥、馬興瑞及多名港區人大代表、政協委員以及立法會議員等獲邀乘坐特別列車「動感號」前往廣州南站，列車以時速超過238公里，上午11時26分由西九龍站開出，不停站經過福田及深圳北，在中午12時07分到達廣州南站。有約二十名建制派議員乘搭列車，其中民建聯立法會議員柯創盛表示，一地兩檢過程順利、快捷。
柯創盛說：紅磡站坐直通火車去廣州東站都要兩小時，但現時透過西九龍「一地兩檢」，我們（香港人）到廣州南站只是四十多分鐘。
獲邀的民主派議員沒出席儀式，亦沒坐列車北上，其中公民黨立法會議員楊岳橋對本台表示，「一地兩檢」破壞一國兩制及香港的法律，沒必要慶祝高鐵通車。
楊岳橋說：當然「一地兩檢」從整個原則、法理基礎上，我們（公民黨）都認為是破壞一國兩制、香港既有的法律邏輯，更何況這條高鐵已經超支，出現那麼多失誤，我們覺得更本沒有必要去慶祝。
廣深港高鐵香港段周日（23日）首日營運，全日有95對列車，當中82對是短途列車，13對為中長途列車。首班車會在早上7時開往深圳北站。首日將會有十個旅行團，乘坐高鐵前往內地。