元朗橫洲發展項目風波，令政府高層矛盾全面浮現。財政司司長曾俊華及政務司司長林鄭月娥，分別發表聲明澄清行政長官梁振英的言論，今次政府內部矛盾表面化的現象在官場實屬罕見。有候任立法會議員批評政府誠信破產，將提出以權力及特權條例調查事件。有學者分析，政府高層各自撇清關係，可能和特首選舉有關，亦會令公眾對政府失去信心，淪為看守政府。（林國立 報道）
元朗橫洲發展項目，由原本計劃興建1.7萬個公營房屋單位，到後來修訂＂縮水＂，先興建4000個，外界質疑政府因鄉事派反對，而減少建屋量，當中亦可能有黑勢力介入，三名政府高層相繼撇清關係。
行政長官梁振英星期一出席活動時指，橫洲相關的工作小組是他統籌，但具體跟進的，是財政司司長曾俊華領導的土地供應督導委員會。但曾俊華當晚隨即發聲明，說自己雖然是工作小組成員，但無出席過會議。政務司司長林鄭月娥也主動撇清關係，指自己從來沒有參與過橫洲相關工作。
行政梁振英星期二出席行政會議前見記者，沒有回應橫洲發展到底是誰拍板決定，只指星期三會和曾俊華一起開記者會交代，又強調政府沒有各自為政。
梁振英說：絕對沒這件事，我們整個政府團隊，過去四年大家可以見到，我們上下一心，確實做了很大的工作，否則今天香港的房屋問題不會這樣。
橫洲事件中，曾被政府官員”摸底”，作非正式諮詢的屏山鄉事委員會主席曾樹和，星期二出席鄉議局會議時就指，梁振英沒有就橫洲發展和他會面。
曾樹和說：都說沒見過梁振英，剛才說過了，各位傳媒，梁振英是否需要管這麼多東西。
一直跟進事件，報稱因此性命受威脅的候任立法會議員朱凱廸，星期二下午就聯同多名反對派議員召開記者會。出席的候任立法會議員劉小麗批評，政府高層的說法令管治誠信破產。
劉小麗說：我們看到特首自己說不關他事，只關財政司司長事，然後財政司司長又說不關他事，最後連林鄭月娥都走出來說，完全不關她的事，到底在這三個人當中，誰在說謊，而在當中我們的管治誠信在那裡，我覺得特首要給我們一個清晰的交代。
朱凱廸就指，他們將會發起以權力及特權條例調查事件。
朱凱廸說：我認為過去一段日子，行政當局在這件事上的表現，已經令市民對行政當局失去信任，我們現在對行政當局的要求，就是要盡快交代所有文件和決策過程，我們立法會是會撥亂反正，我們立法會會可以用我們的力量，將立法會變成法庭，為這件事找回一個真相。
理大社會研究政策中心主任鍾劍華接受本台訪問時指，事件演變成管治危機，政府高層必須”拆彈”，梁振英一向作風都是將責任推給他人，而特首選舉臨近，他亦有可能試圖，將潛在競爭對手曾俊華拖下水。
鍾劍華說：事件讓人懷疑有很多黑幕，梁振英昨天下午的說法，和他一向作風很像，就算沒有特首選舉，他亦會將責任推給他人，再加上這個可能性不能排除，因為曾俊華是一個很明顯，來屆特首的潛在競爭者，如果梁振英到今天還有爭逐連任的動機和意願，他乘機將責任分一些給曾俊華，減輕自己的罪責。
他又指，無論事件是否涉及特首”跑馬仔”，政府高層互相卸除，已經令公眾對政府信心盡失，到明年3月來屆特首誕生前，現屆政府很大機會淪為看守政府，難以有效推動政策。