中國國家主席習近平周三（21日），結束對菲律賓為期兩天的國事訪問。中菲發表聯合聲明，表示雙方不會以武力解決南海問題，又同意建立全面的戰略合作關係。有學者指出，菲律賓總統杜特爾特上任後積極親近北京，並建立更多合作機會，但不意味南海問題已經得到解決。而習近平周二（20日）抵步時，數百名菲律賓民眾在中國駐馬尼拉大使館外集會，抗議當局在南海問題上向中國投降。（文宇晴 報道）
中菲兩國周三（21日）發表的聯合聲明涵蓋31項內容，其中至少有3項涉及到南海問題，表示南海爭議並非中菲關係的全部，雙方致力根據包括《聯合國憲章》和《聯合國海洋法公約》在內的國際法原則，將通過磋商和談判以和平方式處理，不訴諸武力或以武力相威脅。同意兩國在合作共贏基礎上，建立中菲全面戰略合作關係。
官媒引述隨同習近平出訪的國務委員兼外長王毅說話，表示中菲共同開採南海的石油及天然氣的合作邁出實質步伐，共同勘探開發有望提上日程。
香港智明研究所研究總監許楨表示，中菲兩國最主要的矛盾有2個，就是主權和安全問題，以及南海石油以及天然氣開採問題。不過自從總統杜特爾特上台後，主張跟中國改善貿易關係，讓兩國關係拉近了不少。然而，許楨指出，由於中菲兩國本身不是能源特別充沛的國家，隨著雙方經濟高速發展，執行協議仍然存有很多變數，並不意味著南海問題已經得到解決。
許楨說︰中菲關係的改善都是這一年半載的事來的，國事訪問作為其中一個亮點或是象徵性的外交動作之後，有比較大規模或是一些經濟互惠的很合理的。不過在（特爾特）任期後，尤其是對美國或對中國關係有改變之後，這些相關協議執行情況如何？其實未來的變數還有很多。
習近平是13年來首次訪問馬尼拉的中國國家主席，他周二（20日）抵埗後，獲菲律賓總統杜特爾特安排歡迎儀式，又一起檢閱儀仗隊。國務委員兼外長王毅就與菲律賓外長洛欽，簽署近30項的合作協議及諒解備忘錄，當中包括投資、貿易及基建發展以及共同開採南海的石油及天然氣等。
習近平和杜特爾特會見媒體時，均表示未來將加強合作，深化兩國關係，習近平又稱，中方會繼續透過協商解決南海問題。
習近平說︰中菲在南海有廣泛的共同利益，應該繼續通過友好協商管控分歧，推進海上務實合作。中菲兩國將同東盟其他國家一道，在協商一致基礎上爭取未來3年，完成《南海行為準則》磋商，為地區穩定和人民福祉作出應有貢獻。
中國近年在「一帶一路」倡議下，積極投資海外市場或基建項目。然而卻陸續被西方國家質疑其背後有政治目的。
杜特爾特2016年上台後，公開表明「親中遠美」，因而在有主權爭議的南海問題上一直避重就輕。他上任後首度訪華時，中國承諾提供高達240億美元的貸款及投資。不過被媒體發現，金援未如預期，杜特爾特政府宣布的75個大型基建項目中，大部分仍未落實外，真正動工的只有3個基建項目，惹來民眾不滿。
在習近平抵達馬尼拉之前，數百名民眾來到中國大使館外集會，反對菲律賓與中國建立緊密關係。又不滿菲律賓總統杜特爾特上任後，為了獲取中國的經濟援助，出賣菲律賓主權。
示威者高喊︰杜特爾特、習近平，菲律賓是非賣品！
除了集會抗議外，網民亦在社交平台上載大量諷刺習近平的小熊維尼合成圖。
另外，馬尼拉民調機構「社會氣象站」（Social Weather Stations，SWS）在習近平到訪菲律賓的同一天，公布9月時進行的一項民調結果，在1500名受訪者中，有84%受訪者認為，菲律賓政府不應任由中國在南海建造人工島並進行軍事化。約86%受訪者更認為，政府應該加強軍力，尤其是海軍。
菲律賓總統府回應有關的民調結果時表示，民調對象並不了解地緣政治形勢，強調杜特爾特希望透過對話，為國家帶來貿易利益。
南海爭端始於20世紀50年代初，其後中菲兩個多年來就漁民捕魚問題及主權問題，產生矛盾。直至2013年4月初，菲律賓提出南海仲裁。荷蘭海牙國際仲裁法院於2016年7月，裁定中國自行在南海劃設「九段線」、擁有8成南海主權，這是違反《聯合國海洋法公約》。