在台灣，陸委會副主委邱垂正指，大陸的全國人大通過修改香港選舉制度，其實是共產黨直接治港方案，呼籲北京維持對「一國兩制」、「港人治港」的承諾。對於人大期間中國官員重提統一議題，陸委會指是矮化台灣的政治框架，呼籲北京務實展開雙方的良性互動，才有助兩岸關係正向發展。（鍾廣政 台北報道）
陸委會副主委邱垂正表示，人大通過改變香港選舉制度，變相成為共產黨直接治港，最終必受到歷史的嚴格檢驗。
邱垂正說：中國大陸兩會，其中一項就是有關於香港的選制的這個法案通過。我想，中共推行「愛國者治港」，其實是中國共產黨直接治港，也就是所謂的「愛黨者治港」，最終將遭歷史以及人心的嚴格檢視。我們要呼籲相關各方，應該停止蠻橫打壓香港的民主自由，致力於維護香港的高度自治，兌現對港人之承諾。
而對於有200名香港公務人員拒絕簽署「效忠宣言」，可能因此遭解職，邱垂正重申，北京和港府的做法，違背當初「港人治港」高度自治的承諾。
邱垂正說：公務人員忠於職責雖然是天經地義，但是拒絕助紂為虐，也是人之常情，相關執政者一方面背離「港人治港」、「高度自治」的承諾，傷害香港民眾自由、民主、法治等基本權益，一方面又要公務人員白紙黑字宣示表忠，這樣的雙重標準，令天下人不敢苟同。
台灣民眾黨發言人蔡峻維表示，人大通過改革香港選舉制度，讓香港自治更進一步被削弱，以後恐成常態。這次修法增加「愛國者」的區分標準，民眾黨認為此方式荒謬且不合理。中國如果一味把反對派從「內部矛盾」擠向「敵我矛盾」，恐怕只會更失民心。
另外，陸委會副主委邱垂正亦就兩會期間，大陸官員談及涉台問題作出回應。邱垂正質疑大陸矮化台灣的政治框架，他指台灣民意並沒有接受北京所界定「一中原則」和「九二共識」。他呼籲對岸要相互尊重，務實對話處理雙方的分歧，陸委會也會持續關切兩會之後的相關發展，也重申台灣致力維護台海穩定的立場。
邱垂正說：政府致力於維護台海和平、穩定、健康有序的交流，是我們兩岸政策一貫堅定的立場。我們目前也逐步研議推動，有序恢復疫後的兩岸交流往來，以確保人民的權益，以及正常、健康的交流秩序。
中國國務院總理李克強，周四（11日）在人大閉幕後的中外記者會上表示，大陸對台的大政方針是一貫的，也是非常明確的，就是堅持「一個中國」和「九二共識」，在此前提下歡迎台灣任何政黨團體同大陸交往，也願意歡迎台灣各黨派、團體、人士，就兩岸關係和民族未來和大陸開展對話。
李克強說：我們一直秉持兩岸一家親的理念，這些年來可以說出台了很多惠台企、台胞的政策，不少台灣企業和同胞也從中受益。我們會繼續讓台灣同胞來分享大陸的發展機遇，繼續推動兩岸融合發展。
李克強又重申，大陸堅持推進兩岸和平發展和祖國統一，反對任何形式的台獨分裂活動，反對外部勢力干預台灣事務。