在台灣，總統蔡英文發表元旦講話，重申不接受「一國兩制」，並指實施「一國兩制」的香港局勢不斷惡化，讓這個制度信用破產。蔡英文重申新通過的「反滲透法」，只是防止中國滲透，不會影響兩岸交流。前總統馬英九繼續批評「反滲透法」侵害人權，他可能是下一個因此被抓的人。（鍾廣政 台北報道）
總統蔡英文發表元旦講話表示，未來四年，要努力再創造一次經濟起飛的奇蹟，建立一個人民可以普遍受惠、普遍有感的新經濟模式。對於因為中國對台政策改變，而受到衝擊的產業。政府一定會給予支持跟協助，開發新市場、轉型再升級，讓他們擺脫依賴，不再受制於不確定的政治因素。
蔡英文說：當然，台灣之所以重要，絕對不只是因為經濟，我們的民生跟自由也是重要的原因。這幾年來，中國文攻武嚇不停、介入滲透不斷，目標很清楚，就是要逼迫台灣在主權上屈服讓步。去年初，中國國家主席習近平，更提出「一國兩制台灣方案」。我要感謝所有的台灣人民，給了政府最強大的後盾。我們沒有屈服，我們很明確地告訴全世界，台灣不可能接受「一國兩制」。
蔡英文指，這半年多來，全世界都看到，在「一國兩制」實施下的香港，局勢不斷惡化。政府的濫權，已經讓「一國兩制」信用破產。
蔡英文說：民主與威權，無法同時存在於同一國家。香港人民做了示範，告訴我們「一國兩制」絕對不可行。面對中國的壓力，去年我已經提出了「四個必須」，呼籲中國政府：必須要正視中華民國存在的事實；必須要尊重兩千三百萬人民對自由民主的堅持；必須以和平對等的方式，來處理我們之間的歧異；必須是政府，或政府所授權的公權力機關，坐下來談。
蔡英文重申，周二（12月31日）通過的「反滲透法」，不會影響自由、不會侵犯人權，不會影響正常經貿交流，它只會讓台灣的民主自由更受保障。
蔡英文強調，她是要反滲透，不是反交流。兩岸之間的正常交流和往來，都不會被這個法案影響。
蔡英文說：在中國的台商、台生、台師、台幹，各位的一切正常生活都可以照舊，不受影響。拜媽祖的，或是拜其他神明的人，所有正常宗教交流活動，也不會受到影響。兩岸之間的觀光活動，旅行業者的正常生意，也絕對不會受到影響。
不過，前總統馬英九就繼續批評「反滲透法」侵害人權，違反憲法。
馬英九說：「反滲透法」等於是恢復戒嚴，各位知道嗎？就在不久之前台大的蘇宏達教授，因為批評故宮南院的政策，結果被警察依照《社會維護法》去約談，同樣另外一位姓陳的市民也碰到同樣的遭遇。我長期來批評「反滲透法」，說不定下一個就是我，但是我一點都不害怕，因為這個法律違憲、違法，完全沒有程序的正義。
馬英九指出，「反滲透法」範圍廣、定義含糊，若規定不清楚，產生冤案、錯案、假案的機會就非常大。