台灣和薩爾瓦多斷交，引發島內各政黨間和政府部門爭論。陸委會發表聲明譴責北京當局，並認為大陸無視台灣持續釋出和平對話的善意。行政院前院長張善政批評，民進黨這樣處理兩岸關係不流失邦交國才怪。也有立委認為，北京看準薩爾瓦多的地理位置，要在美國後院建立軍事基地。（鍾廣政 台北報道）
總統蔡英文結束中南美洲訪問，周一（20日）深夜返抵台灣時，神情愉悅的發表演講表示，在出訪過程中代表國家，和邦交國及非邦交國的元首及代表當面交流，展現臺灣對自由民主價值的堅持，以及進一步與國際社會交往的決心。
蔡英文說：走出去的路上，即使受到打壓，我們也用實際的行動去告訴國際社會，臺灣不會因為壓力而屈服。打壓只會讓我們更堅強、更團結、讓我們走出去的決心更堅定。
在和薩爾瓦多斷交後，大陸委員會立即發表聲明表示，中共不斷強奪台灣邦交國，意圖壓迫台灣屈從其政治主張，再次印證北京方面對台海情勢的錯判。中華民國政府對於粗暴封鎖國際生存空間的霸權，表達強烈抗議與譴責。
陸委會強調，對岸無視台灣方面持續釋出和平對話的善意，一再打壓屈辱台灣，是惡意破壞台海及區域和平穩定的亂源。北京當局「口蜜腹劍」傷害台灣民眾情感與權益，台灣只會更加堅定團結，兩岸心理距離也只有愈來愈背離。
民進黨立委王定宇指出，中國這次行動居心叵測，除了挖台灣邦交國外，也是對美國軍事挑釁的開始。
王定宇說：薩爾瓦多想改變用途，把港口變成軍港，而那個地方就在美國後門。所以美國駐薩爾瓦多大使馬內斯（Jean Manes）在幾個月前就公開講，中國想用錢把這個港口買下來，台灣要注意。他對這個地方改成軍事據點表示反對，強調會失去美國這個貿易國。
行政院前院長張善政表示，如果將來再有國家和台灣斷交，他一點也不會意外。
張善政說：現在看蔡政府的作風，不跟我們斷交才是奇怪。你每次出訪回來就少一個國家，對不對？才回來一天又少一個國家。我說，我們心裡面有底但是不講，會被說唱衰。但是現在事實已經明顯，我想，蔡政府要好好檢討，兩岸的關係不是這樣搞的。
國民黨立法院黨團書記長曾銘宗表示，薩爾瓦多關係生變從今年WTO會議上該國未發言支持台灣，既已透露不尋常端倪，但外交部的警覺性卻仍處於鴕鳥模式，部長吳釗燮甚至一再對國會宣稱薩國是「安全名單」，自我麻痺的心態非常可笑。
時代力量立委黃國昌認為，蔡英文政府應該調整「維持現狀」的政策，因為現狀已遭中國嚴重破壞，他也要求將陸委會併入外交部，陸委會已經沒有存在的必要。