Khi được các đại biểu hỏi về tình trạng thất thoát đáng ngại của các tập đoàn nhà nước, như Vinashin, Vinalines, ông Nguyễn Xuân Phúc mô tả màu hồng rằng "mỗi một thất thoát, mỗi hiện tượng xã hội nào không tốt, một con tàu đi ngoài khơi bị chìm, đến những máy bay bị nổ đều liên quan đến trách nhiệm của chính phủ, đến các Bộ, ngành liên quan".
Về vấn đề công ty nhà nước thiếu công khai, minh bạch, ông Phúc viện dẫn báo cáo của Phó Thủ tướng Vũ Văn Ninh trình Quốc Hội, qua đó, khẳng định trong thời gian tới, tất cả các tập đoàn, tổng công ty nhà nước phải công khai, minh bạch để có sự giám sát tốt hơn.
Liên quan vấn đề cải cách hành chính, chống tham nhũng, ông Nguyễn Xuân Phúc lưu ý rằng dù thủ tục gì đi chăng nữa, cán bộ nhà nước tiêu cực, tham nhũng thì “không thủ tục nào giải quyết nỗi”. Ông nhìn nhận nạn tham nhũng, lãng phí hiện vẫn còn nghiêm trọng, tiếp diễn ở nhiều ngành, nhiều cấp, nhiều lãnh vực, nhất là trong việc quản lý, sử dụng đất đai…